Na planta original da edificação cada cômodo recebeu um número e a legenda apresenta a que se refere esse cômodo.
No caso dos cômodos de nº4, lê-se: “os doIs segredos”, ou os dois segredos.
Na revista número 11 do IPHAN, diz-se que ‘Segredo é uma casa “em que se metem pessoas por culpa grave por tantos dias, e lhe vão fazer perguntas,
e dar tratos para os obrigar a confessar a verdade’. Dar tratos [...] significa torturar”.
Os dois segredos de Mariana eram salas que possuíam uma única porta de entrada a qual dava para a casa do carcereiro, sem janelas, onde somente as pessoas autorizadas poderiam ter acesso.